More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1203 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1203  response regulator of chemotaxis  100 
 
 		 123 aa  242  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.266578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  40.5 
 
 		 209 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 265 aa  87.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  36.84 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 265 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  36.45 
 
 		 266 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 265 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 265 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 267 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  31.4 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  38.02 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32.23 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  33.06 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  33.88 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.9 
 
 		 905 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  35.14 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  31.4 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3924  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  29.75 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  31.4 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 808 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  33.88 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  31.4 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  33.88 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  30 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  31.4 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  29.75 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  33.88 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  31.4 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  32.23 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  30.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  33.33 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  32.23 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>