More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3627 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  67.44 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  60.16 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  56.59 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  55.81 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  55.81 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  56.59 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  55.38 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  45.08 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2433  chemotaxis response regulator, CheY2  42.19 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1097  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1797  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  42.62 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  42.62 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  44.92 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 127 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  40.5 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  38.71 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  40.48 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  95.9  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  40.65 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  37.7 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  39.34 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  42.86 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  39.67 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  37.7 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  36.89 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  41.67 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  37.7 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  37.7 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  36.89 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  36.07 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  36.07 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  34.17 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 395 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 139 aa  90.5  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>