More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0302 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  95.35 
 
 
129 aa  248  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  90.7 
 
 
129 aa  236  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  58.14 
 
 
129 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  55.81 
 
 
129 aa  150  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  53.12 
 
 
129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  49.22 
 
 
129 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  44.53 
 
 
128 aa  120  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  42.19 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1797  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2433  chemotaxis response regulator, CheY2  42.97 
 
 
128 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1097  response regulator receiver protein  42.19 
 
 
129 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363712  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
127 aa  97.4  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  39.2 
 
 
131 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
130 aa  94  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  39.2 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  38.4 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  39.2 
 
 
131 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  34.4 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  38.4 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  39.2 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  36.8 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  37.1 
 
 
128 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  39.34 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 
126 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 
137 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 
124 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.14 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  33.86 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  32.54 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  35.43 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
126 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
128 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  34.4 
 
 
139 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  35.2 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  35.43 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  34.68 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  33.88 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  35.43 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  35.54 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  36.13 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  35.43 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  37.82 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.07 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  33.87 
 
 
127 aa  84  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  33.87 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
133 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 
127 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  33.87 
 
 
127 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  33.61 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
133 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
123 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
126 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
122 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
128 aa  84  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  35.43 
 
 
127 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  35.43 
 
 
127 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  35.43 
 
 
127 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  33.88 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  42.02 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
395 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  32.54 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  33.06 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.61 
 
 
371 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  36.22 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  33.88 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  32.54 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  33.06 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>