More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2712 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  62.6 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  55.38 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  50.77 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  49.23 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  48.09 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  45.53 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  46.72 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  45.53 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  45.53 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  45.53 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  43.08 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  47.29 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  45.53 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  45.53 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  39.2 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  45.31 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  46.09 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  42.97 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  40 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  40.62 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  44.09 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  45.9 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  39.06 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  40 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  45.08 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  45.08 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  43.9 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  44.26 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  36.8 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  37.5 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2433  chemotaxis response regulator, CheY2  41.54 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  35.43 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  40.32 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  37.5 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  40.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  35.16 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  40.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  40.32 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  40.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.32 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  40.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  40.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  40.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  36.8 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  37.1 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1097  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  38.4 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  38.4 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  38.4 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  34.38 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  36.8 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1797  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  35.16 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  40 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>