More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2433 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2433  chemotaxis response regulator, CheY2  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1097  response regulator receiver protein  99.22 
 
 		 129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1797  response regulator receiver protein  94.53 
 
 		 128 aa  228  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  60.94 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  57.81 
 
 		 128 aa  167  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  44.53 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  42.97 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  37.17 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.43 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.43 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  36.22 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  35 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  33.33 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  32.54 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  34.68 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  35.19 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  37.61 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.33 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  33.33 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  33.07 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  31.71 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  33.61 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  34.68 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>