More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2838 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2433  chemotaxis response regulator, CheY2  57.81 
 
 
128 aa  153  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1797  response regulator receiver protein  57.03 
 
 
128 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1097  response regulator receiver protein  57.03 
 
 
129 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363712  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  53.91 
 
 
128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  46.09 
 
 
129 aa  121  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  46.09 
 
 
129 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  45.08 
 
 
129 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  44.53 
 
 
129 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  44.53 
 
 
129 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  47.54 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  42.19 
 
 
129 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  43.08 
 
 
131 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  35.94 
 
 
129 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
121 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35.59 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  32.54 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
131 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  39.83 
 
 
131 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.97 
 
 
129 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  37.1 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 
131 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 
131 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  33.9 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  36.44 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
126 aa  84.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  34.13 
 
 
128 aa  84  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  32.52 
 
 
129 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  33.86 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  33.86 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  33.06 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  31.97 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  32.26 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  31.97 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  32.52 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.05 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  31.97 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  33.05 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  34.15 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  30.89 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  30.89 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  33.88 
 
 
209 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  30.89 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  30.89 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  30.89 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  33.61 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  33.06 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  31.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  31.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  32.79 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  33.94 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  31.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  32.79 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  32.79 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  31.71 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  30.33 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  31.45 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  32.81 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  31.15 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  32.2 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  31.15 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  30.33 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  31.09 
 
 
265 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  30.33 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  31.15 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  33.04 
 
 
266 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>