More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3471 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  262  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  52.71 
 
 		 129 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  52.34 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  51.56 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  49.22 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  49.22 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  48.09 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  38.4 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  40.83 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  40 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  41.18 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  40 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  37.6 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  41.46 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  42.37 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  40.83 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  40.83 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  39.84 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  38.66 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  38.66 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  38.33 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  38.21 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  37.4 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  37.4 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  38.84 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  37.4 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  38.21 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  37.4 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  37.4 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  37.82 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  37.82 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  37.82 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  41.32 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  37.4 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  38.21 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>