More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1442 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  258  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  67.44 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  58.59 
 
 		 129 aa  156  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  58.14 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  58.14 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  58.14 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  58.91 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  47.54 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2433  chemotaxis response regulator, CheY2  42.97 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1097  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 129 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1797  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  40.48 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  39.68 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  36.29 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  37.7 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  41.18 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  41.18 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  37.7 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  35.94 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  33.61 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  34.15 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  34.15 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  37.19 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  33.61 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  37.4 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  35.25 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  34.43 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  35.25 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>