More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3203 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  260  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2433  chemotaxis response regulator, CheY2  60.94 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1097  response regulator receiver protein  60.16 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  53.91 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1797  response regulator receiver protein  57.03 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  44.53 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  40 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  34.96 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  34.96 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  36.59 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  31.71 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.13 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.13 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  31.75 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  31.71 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  35.77 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  35.77 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  35.77 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  37.1 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  36.29 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  34.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  34.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  30.95 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  36.51 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32.81 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  34.96 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  34.13 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  36.29 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 395 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  32.52 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>