More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3115 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  100 
 
 		 395 aa  813    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  40.65 
 
 		 139 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 132 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  40.65 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  41.46 
 
 		 129 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  40.16 
 
 		 131 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 131 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 132 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 129 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  38.52 
 
 		 148 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 131 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 131 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 131 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 131 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 131 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 131 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 131 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 127 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 129 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 129 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 131 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 131 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 188 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  38.21 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 129 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  43.31 
 
 		 134 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 129 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 129 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 127 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  99.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  34.96 
 
 		 131 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 139 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 127 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 132 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  34.96 
 
 		 128 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 126 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  34.15 
 
 		 127 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 130 aa  97.1  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 126 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 		 131 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 128 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 128 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  38.66 
 
 		 124 aa  96.3  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  35.77 
 
 		 130 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  35.77 
 
 		 130 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 128 aa  96.3  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 126 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  39.84 
 
 		 131 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 131 aa  96.3  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  34.96 
 
 		 128 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  34.96 
 
 		 126 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 131 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 133 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 137 aa  95.5  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 128 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 135 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  34.15 
 
 		 130 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  39.84 
 
 		 129 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.15 
 
 		 130 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 126 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  40.16 
 
 		 133 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 127 aa  92.8  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 131 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>