More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1366 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  97.71 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  96.18 
 
 		 131 aa  259  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  94.66 
 
 		 131 aa  255  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  94.66 
 
 		 131 aa  251  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  91.6 
 
 		 131 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  88.8 
 
 		 129 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  82.26 
 
 		 127 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  82.26 
 
 		 127 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  82.26 
 
 		 127 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  82.26 
 
 		 127 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  83.06 
 
 		 127 aa  218  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  83.06 
 
 		 127 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1718  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  89.47 
 
 		 114 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123657  normal  0.330676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  74.02 
 
 		 128 aa  205  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  71.88 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  56.1 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  55.2 
 
 		 137 aa  153  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  55.28 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  55.28 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  55.28 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  55.28 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 188 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  56.91 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  55.28 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  54.47 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  55.28 
 
 		 135 aa  147  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  56.9 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  54.92 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  54.4 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  55.28 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  55.74 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  55.74 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  53.28 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  54.4 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  54.92 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  53.66 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  53.97 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  52.85 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  55.93 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  54.1 
 
 		 129 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  53.28 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  53.17 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  55 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  53.6 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  53.33 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  53.33 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  51.22 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>