More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1263 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 383 aa  139  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  43.65 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  40 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  43.09 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  41.46 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  38.66 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  43.22 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 385 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 385 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  45.54 
 
 		 386 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  37.07 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  42.86 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  39.47 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  39.47 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 188 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  40.32 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  37.5 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 928 aa  87.8  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  39.83 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 406 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  39.52 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 406 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 275 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  39.17 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  39.83 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>