More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4677 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  80.17 
 
 		 121 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  76.03 
 
 		 121 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  70.25 
 
 		 121 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  61.54 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  57.98 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  58.47 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  57.98 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  59.32 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  53.45 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  54.7 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  58.97 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  51.28 
 
 		 121 aa  127  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  52.14 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  52.14 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  50.43 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  51.67 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  53.85 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  55 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  55.83 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  51.28 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  52.1 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  52.54 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  50 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  50 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  46.67 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  52.14 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  46.67 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  46.55 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  48.72 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  49.57 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  42.74 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  42.74 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  48.28 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  44.54 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  44.44 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  45.69 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  44.54 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  46.55 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  49.17 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  44.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  43.1 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  103  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  49.54 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  48.62 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  48.62 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  48.62 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  39.5 
 
 		 123 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>