More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0659 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  81.13 
 
 		 265 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  80 
 
 		 265 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  78.11 
 
 		 265 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  78.11 
 
 		 265 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  78.11 
 
 		 265 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  78.11 
 
 		 265 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  75.47 
 
 		 265 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  75.85 
 
 		 265 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  75.09 
 
 		 267 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  73.96 
 
 		 265 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  72.83 
 
 		 265 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  71.21 
 
 		 266 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  70.57 
 
 		 265 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 266 aa  278  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  49.42 
 
 		 265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  54.59 
 
 		 209 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  43.02 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.52 
 
 		 131 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 127 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 135 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 		 127 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 127 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  36.59 
 
 		 127 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 126 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.15 
 
 		 130 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.15 
 
 		 130 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 139 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  34.43 
 
 		 126 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  34.43 
 
 		 130 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  40.98 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.33 
 
 		 128 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.43 
 
 		 130 aa  92  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 128 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  35 
 
 		 122 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 128 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 131 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 127 aa  91.3  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  32.52 
 
 		 148 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  33.61 
 
 		 128 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  34.15 
 
 		 129 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  33.06 
 
 		 124 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 131 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 131 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 131 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 131 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 131 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 131 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 131 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 131 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  34.71 
 
 		 129 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 127 aa  89  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 127 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 		 124 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  34.71 
 
 		 131 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 125 aa  87.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  38.33 
 
 		 121 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 132 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  31.71 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 128 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  31.71 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 128 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 130 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 132 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  41.12 
 
 		 121 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>