More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4001 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  55.36 
 
 		 523 aa  260  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 524 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 524 aa  250  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4166  response regulator  33.03 
 
 		 508 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 126 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 126 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 139 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  37.7 
 
 		 128 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 127 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  39.32 
 
 		 124 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  41.8 
 
 		 130 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  38.52 
 
 		 128 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 128 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  41.8 
 
 		 130 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 127 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 135 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  39.34 
 
 		 127 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 126 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  36.8 
 
 		 131 aa  101  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 127 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  41.88 
 
 		 122 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.99 
 
 		 863 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  39.2 
 
 		 130 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  39.34 
 
 		 126 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 128 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 128 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 128 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 126 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 127 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 127 aa  98.6  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 127 aa  98.6  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  37.61 
 
 		 124 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 126 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  30.36 
 
 		 1161 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 126 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  36.89 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  40.68 
 
 		 124 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 137 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1159 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2262  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.5 
 
 		 853 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 126 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 133 aa  95.5  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 129 aa  95.1  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  38.46 
 
 		 148 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 129 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  36.89 
 
 		 129 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 137 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 132 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  39.32 
 
 		 129 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  39.32 
 
 		 129 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  39.32 
 
 		 129 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 128 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 130 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 126 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 1054 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 132 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  35.25 
 
 		 129 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 		 129 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  36.07 
 
 		 129 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  36.36 
 
 		 129 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  31.56 
 
 		 1188 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  36.75 
 
 		 129 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 131 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  58.33 
 
 		 365 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 131 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  35.54 
 
 		 131 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1238 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  35.25 
 
 		 131 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  35.25 
 
 		 131 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  35.25 
 
 		 131 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>