More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5482 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  100 
 
 		 297 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  90.91 
 
 		 294 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  72.41 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  74.16 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  75.17 
 
 		 296 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  73.15 
 
 		 296 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  72.94 
 
 		 302 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  73.75 
 
 		 300 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  67 
 
 		 300 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  66.67 
 
 		 300 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  40.47 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  46.71 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  40.21 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 127 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 130 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 135 aa  92  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 126 aa  92.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 127 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 128 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  37.1 
 
 		 124 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.13 
 
 		 229 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  37.6 
 
 		 128 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 126 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 126 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 127 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 128 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 126 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 127 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 126 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 137 aa  89  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 124 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 126 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  36.8 
 
 		 127 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 127 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 128 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 128 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.89 
 
 		 131 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  41.46 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  41.46 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  41.46 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.61 
 
 		 472 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  40.16 
 
 		 148 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  32 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.33 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 127 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 139 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  36.29 
 
 		 124 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 129 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.29 
 
 		 128 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  37.6 
 
 		 122 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 123 aa  86.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 123 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 127 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  36 
 
 		 127 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  36.29 
 
 		 130 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.72 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  36.29 
 
 		 126 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  38.58 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.4 
 
 		 139 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  36.29 
 
 		 130 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 126 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  38.58 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.49 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  30.14 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2074  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  36.8 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0959  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.45 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.159493 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2163  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>