More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0184 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  73.93 
 
 		 297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  76.14 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  76.57 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  71.62 
 
 		 294 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  67.81 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  72.85 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  72.19 
 
 		 294 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  72.52 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  69.87 
 
 		 300 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 298 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  41.4 
 
 		 288 aa  230  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  43.64 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 126 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 127 aa  99.8  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 130 aa  99.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 126 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 126 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 126 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 126 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 126 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 127 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 126 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 131 aa  92.4  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  40.46 
 
 		 126 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  37.6 
 
 		 128 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 		 127 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.6 
 
 		 128 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 127 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 127 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 124 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.8 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.8 
 
 		 229 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 135 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  36 
 
 		 128 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 127 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 132 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 137 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  39.52 
 
 		 130 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  39.67 
 
 		 139 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  36 
 
 		 128 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 127 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 128 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  40.32 
 
 		 127 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 229 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  36.29 
 
 		 124 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  36.29 
 
 		 124 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  34.4 
 
 		 248 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36 
 
 		 128 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.4 
 
 		 248 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  38.71 
 
 		 127 aa  89.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 229 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 122 aa  89.4  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  38.71 
 
 		 130 aa  89  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.12 
 
 		 900 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 127 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 394 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  38.71 
 
 		 126 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  37.9 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.1 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 127 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 126 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 123 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 125 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 123 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 127 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 231 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  36 
 
 		 139 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  36.59 
 
 		 229 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  36.59 
 
 		 229 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 130 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  37.19 
 
 		 121 aa  86.7  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 130 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  36.51 
 
 		 148 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  35.71 
 
 		 229 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  38.84 
 
 		 130 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 127 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  39.2 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 131 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.58 
 
 		 472 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 133 aa  85.9  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  37.19 
 
 		 121 aa  85.9  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>