More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2351 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1933  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.14 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.6 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2815  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0395  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.7 
 
 		 240 aa  214  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.37 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  46.93 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  52.51 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.62 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  49.77 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.46 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  44.59 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.54 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.36 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  54.22 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  43.72 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2766  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.96 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  48.89 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  45.13 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.61 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  45.41 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  43.3 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  47.56 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.88 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  50 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  49.08 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  47.75 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>