More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2766 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2766  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  95.98 
 
 		 236 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  61.26 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.66 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2815  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1933  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2108  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.1 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  44.64 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0395  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 235 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00362669  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  47.98 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.44 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  42.79 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.82 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.61 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.09 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  46.88 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.86 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.41 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.69 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  43.81 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  41.41 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 261 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  43.11 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.67 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  43.11 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  43.11 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  43.11 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  43.11 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  43.11 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  46.12 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  45.41 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  43.11 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  43.11 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.05 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.05 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.98 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.09 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.75 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.05 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.05 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>