More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3871 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1933  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.48 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0395  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.11 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  57.01 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.98 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  50.67 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  51.13 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2815  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.42 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.98 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.55 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 230 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  49.32 
 
 		 230 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  46.02 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  44.64 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.61 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  46.75 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.4 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  48.43 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  45.13 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.69 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  45.13 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  45.13 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  45.13 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  45.13 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  45.13 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  45.13 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  45.13 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  48.18 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  45.33 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  43.04 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  44.2 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  42.41 
 
 		 256 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 245 aa  184  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.61 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>