More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3119 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  93.33 
 
 		 120 aa  224  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  85 
 
 		 120 aa  206  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  85 
 
 		 120 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  203  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  82.5 
 
 		 120 aa  200  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  81.97 
 
 		 122 aa  199  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  59.17 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  48.33 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  45.08 
 
 		 139 aa  103  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  41.53 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  44.17 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  43.33 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  43.33 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  43.33 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  42.37 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  38.02 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  42.74 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  42.5 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 298 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  45.61 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  44.54 
 
 		 2284 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 385 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 385 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.53 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 386 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  47.97 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  41.67 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  39.17 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  41.96 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  40.68 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  43.36 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.82 
 
 		 394 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  43.7 
 
 		 2301 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  44.14 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 283 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  40 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  39.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  41.07 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.96 
 
 		 314 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 509 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 188 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>