More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4999 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  247  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  74.17 
 
 		 119 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  72.27 
 
 		 120 aa  177  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  70.83 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 298 aa  168  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  67.52 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  43.8 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  40.17 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  42.15 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  42.98 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  42.15 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  42.15 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  42.5 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  39.66 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  41.67 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  43.7 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.02 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  38.71 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  39.02 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  43.12 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  41.32 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 131 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.21 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  41.32 
 
 		 188 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 121 aa  83.6  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  38.71 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>