More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0663 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  39.02 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  36.13 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  35.77 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  33.87 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  36.97 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 707 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  33.06 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  33.06 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  34.45 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  34.68 
 
 		 1334 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  32.52 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  30.83 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  31.4 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 265 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 265 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  30.89 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  30.89 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  39.34 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  33.33 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 1616 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  32 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 386 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>