More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2695 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  36.13 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 383 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  36.13 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  35.48 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 241 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  36.28 
 
 		 241 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  36.7 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  34.45 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  35.54 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0931  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  35.77 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 406 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  37.17 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 227 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  30.58 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2223  chemotaxis protein CheY  44.44 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 406 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  36.44 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  33.33 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 		 368 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  35 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1534  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.45 
 
 		 456 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  32.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.9 
 
 		 767 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  37.72 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.12 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1127 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.82 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  29.51 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  28.33 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.55 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 1098 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2682  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  35.04 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 1098 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  34.19 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  33.33 
 
 		 764 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.83 
 
 		 1180 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 866 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>