More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  100 
 
 		 123 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  69.92 
 
 		 127 aa  184  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 127 aa  179  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  69.67 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  69.17 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  63.25 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  41.53 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  44.25 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  44.25 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  44.25 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  44.25 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  41.88 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  43.36 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  42.48 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  44.25 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  41.59 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  42.48 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  43.36 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  44.25 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  43.36 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  44.64 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  45.54 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  41.59 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  42.48 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  43.75 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  41.59 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  43.75 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  41.59 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  41.59 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  41.59 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  41.59 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  41.59 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  93.6  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  41.59 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 129 aa  93.2  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  42.48 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  40.71 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  43.36 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  40.17 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  43.36 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  43.36 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 123 aa  91.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2874  response regulator receiver  48.67 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  42.45 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>