More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0522 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  100 
 
 		 121 aa  251  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  91.74 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  91.74 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  91.74 
 
 		 121 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  90.91 
 
 		 121 aa  229  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  89.26 
 
 		 121 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  88.43 
 
 		 121 aa  225  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  75.21 
 
 		 129 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 121 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 124 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  67.23 
 
 		 130 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  63.64 
 
 		 123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  66.12 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  64.71 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  60.53 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  49.18 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  45.76 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 122 aa  93.6  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  38.33 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  41.12 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 394 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  31.62 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  37.82 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.72 
 
 		 352 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  40.78 
 
 		 513 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2607  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.93 
 
 		 711 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.75 
 
 		 2336 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 474 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 414 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.48 
 
 		 423 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 887 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 298 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  37.74 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.79 
 
 		 2284 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 248 aa  80.1  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1974 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  37.93 
 
 		 2301 aa  79.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  39.45 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  35.59 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  37.07 
 
 		 795 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.62 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.22 
 
 		 1499 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 383 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 870 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 802 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 443 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 612 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 385 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 385 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.19 
 
 		 303 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  37.25 
 
 		 734 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 386 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>