More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1738 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  258  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  74.8 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  60.33 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  56.2 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  56.2 
 
 		 121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  56.2 
 
 		 121 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  57.85 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  54.55 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  54.55 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  54.55 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  54.84 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 137 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  48.25 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  41.8 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  40.34 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 414 aa  84.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  41.18 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  41.74 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  41.03 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  42.98 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  40.65 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  42.61 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 248 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  42.61 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.34 
 
 		 423 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  41.74 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  41.74 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.98 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 394 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1994  two component signal transduction response regulator  38.79 
 
 		 477 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  35.96 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 1066 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.34 
 
 		 318 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.95 
 
 		 378 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  37.72 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  36.84 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>