More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1531 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  99.29 
 
 		 140 aa  286  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  89.55 
 
 		 137 aa  247  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  71.67 
 
 		 121 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  72.88 
 
 		 130 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 121 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  69.75 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  68.91 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  68.07 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  67.23 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  66.39 
 
 		 121 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  64.71 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  63.03 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  62.81 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  58.82 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  57.98 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  57.98 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  45.3 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  46.85 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  47.11 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.74 
 
 		 711 aa  87.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  41.67 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2008  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  38.74 
 
 		 414 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  38.14 
 
 		 513 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.91 
 
 		 1131 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.33 
 
 		 2336 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 352 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.63 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.26 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  38.24 
 
 		 734 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.88 
 
 		 767 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  38.32 
 
 		 381 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  39.81 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  38.26 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  38.26 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  38.26 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  39.64 
 
 		 462 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  38.26 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  38.26 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 387 aa  77  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  33.33 
 
 		 192 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 407 aa  76.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  37.39 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1646 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 2212 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  40.57 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1646 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  40.38 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1383  response regulator  38.39 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1002 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  37.39 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1725 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  38.71 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1725 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1647 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.71 
 
 		 1992 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  39.66 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  33.08 
 
 		 2301 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  37.39 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.22 
 
 		 2458 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.34 
 
 		 718 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>