More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3676 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  100 
 
 		 121 aa  250  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  98.35 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  97.52 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  94.21 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  94.21 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  91.74 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  91.74 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  78.51 
 
 		 129 aa  207  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 121 aa  201  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  75 
 
 		 121 aa  199  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  69.42 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  69.75 
 
 		 130 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  66.94 
 
 		 123 aa  177  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  68.91 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  65.83 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  68.91 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  67.77 
 
 		 121 aa  170  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  64.46 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  61.4 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  53.28 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  44.07 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  41.67 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  41.03 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  38.46 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  39.81 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.79 
 
 		 711 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 318 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  32.48 
 
 		 119 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  40.78 
 
 		 513 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  40.52 
 
 		 2284 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.44 
 
 		 2336 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.66 
 
 		 2301 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 394 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2607  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 443 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  39.13 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  39.32 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.48 
 
 		 423 aa  81.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 		 474 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 887 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  37.29 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 251 aa  80.9  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  38.46 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  38.68 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  35.59 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  37.93 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  39.17 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  40.17 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 716 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 870 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  38.68 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>