More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2008 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2008  response regulator receiver protein  100 
 
 		 404 aa  823    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  44.96 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2000  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.41 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2910  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 215 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2893  response regulator  44.35 
 
 		 215 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000624978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2366  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 215 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2621  two-component response regulator  44.35 
 
 		 215 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2867  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 215 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000859212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2877  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 215 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.46 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  37.67 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.97 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.3 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2666  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.800154  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1615  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000138875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2669  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 199 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0406504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2590  response regulator  42.74 
 
 		 215 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0044189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 231 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  40.38 
 
 		 244 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  44.25 
 
 		 1177 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  42.62 
 
 		 240 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  43.41 
 
 		 230 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 316 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 231 aa  99.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.38 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  34.03 
 
 		 322 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  34.43 
 
 		 1127 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 229 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 228 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.46 
 
 		 234 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  99.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 232 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 229 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.96 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 237 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 229 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  40.52 
 
 		 1207 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  36.18 
 
 		 229 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  44.54 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  42.86 
 
 		 243 aa  98.2  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  43.7 
 
 		 243 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  36.55 
 
 		 229 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  43.7 
 
 		 243 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 		 227 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  45.38 
 
 		 243 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 303 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0255  DNA-binding response regulator  36.48 
 
 		 226 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 234 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 237 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 238 aa  97.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 229 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  43.7 
 
 		 243 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.58 
 
 		 237 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 272 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0898  DNA-binding response regulator  35.02 
 
 		 234 aa  96.7  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 241 aa  96.3  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 238 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  38.81 
 
 		 302 aa  96.3  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  40.83 
 
 		 228 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  39.1 
 
 		 230 aa  96.3  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 246 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  42.02 
 
 		 254 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 254 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  43.7 
 
 		 243 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  43.7 
 
 		 245 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1408  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.91 
 
 		 500 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  42.02 
 
 		 254 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2564  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 228 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 227 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 228 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  46.02 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  35.06 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 229 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 231 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 238 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.46 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 240 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 235 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 314 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 229 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 251 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.29 
 
 		 231 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 224 aa  94.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  42.64 
 
 		 221 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  42.98 
 
 		 1111 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  42.86 
 
 		 245 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 232 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 227 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.5 
 
 		 229 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.5 
 
 		 229 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>