More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1615 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1615  response regulator receiver protein  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000138875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  54.41 
 
 		 301 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2000  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.18 
 
 		 364 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000423497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  41.15 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.52 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  51.16 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.27 
 
 		 423 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 302 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  46.03 
 
 		 337 aa  111  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.96 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  45.67 
 
 		 418 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  40.49 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  40.74 
 
 		 422 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  47.66 
 
 		 316 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.62 
 
 		 407 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1706  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.64 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2008  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 400 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4030  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000171088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.86 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  47.86 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.17 
 
 		 412 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.11 
 
 		 378 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.32 
 
 		 379 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 509 aa  98.2  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.65 
 
 		 917 aa  98.2  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.71 
 
 		 380 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.88 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.09 
 
 		 316 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  32.73 
 
 		 369 aa  96.3  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  46.09 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.96 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.96 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2666  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.800154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  37.67 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 1361 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  37.36 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2910  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  44.83 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.6 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.86 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 1383 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2877  DNA-binding response regulator  43.52 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  45.93 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2621  two-component response regulator  42.59 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2867  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000859212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 139 aa  95.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2893  response regulator  43.52 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000624978  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  45.69 
 
 		 246 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  43.97 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  32.4 
 
 		 397 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  45.22 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  41.27 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2590  response regulator  43.52 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0044189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2366  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  47.41 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 433 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>