More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2564 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2564  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.28 
 
 		 221 aa  278  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.39 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0087  two component transcriptional regulator  63.93 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 231 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  51.98 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2598  two component transcriptional regulator  70.45 
 
 		 134 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.68 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 222 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.06 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 231 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  46.64 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  42.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  42.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  42.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  42.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  44.3 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  42.17 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  42.17 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.92 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  44.14 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2504  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2210  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  44.64 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.69 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.41 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  43.69 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  43.95 
 
 		 229 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  48.23 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  43.69 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  43.69 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  43.69 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  45.33 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.78 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>