More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4033 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  73.73 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  69.75 
 
 		 121 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  71.19 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  69.75 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  70.59 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  72.88 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  72.88 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  68.91 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  67.23 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  66.39 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  67.23 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  51.24 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  45.61 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  43.8 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  43.7 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 394 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  40.32 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  40.17 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  41.38 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 385 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 385 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  41.07 
 
 		 386 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  40.98 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  40.32 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  40.16 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  38.52 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  40.16 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  40.5 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  40.16 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  38.14 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40.87 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40.87 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  37.7 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40.87 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  39.67 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  42.59 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  41.88 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>