More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0660 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  69.42 
 
 
121 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  69.42 
 
 
121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  68.6 
 
 
121 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  66.94 
 
 
121 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  66.94 
 
 
121 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  66.94 
 
 
121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  65.85 
 
 
123 aa  176  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  66.94 
 
 
121 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  64.23 
 
 
129 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  64.46 
 
 
121 aa  174  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  64.71 
 
 
130 aa  164  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  64.17 
 
 
121 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  63.33 
 
 
121 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  61.98 
 
 
122 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
137 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  58.68 
 
 
124 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  58.82 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  58.82 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  49.18 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  51.79 
 
 
121 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  46.67 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
127 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  42.37 
 
 
124 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
141 aa  100  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  43.33 
 
 
131 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
127 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  42.02 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  42.45 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.79 
 
 
318 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  41.28 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
123 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.09 
 
 
423 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  35.34 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
129 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  35.34 
 
 
121 aa  84  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  39.47 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  39.62 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  39.47 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  39.47 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  37.38 
 
 
423 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  39.62 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
394 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  38.68 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  34.82 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  36.67 
 
 
1278 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  43.81 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.1 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  39.62 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  35.65 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  35.65 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.96 
 
 
767 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  36.21 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  35.65 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  35.65 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  42.86 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  34.21 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.82 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  34.78 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  37.72 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.68 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  37.19 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  35.65 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  41.9 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  35.65 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  31.3 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  32.17 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>