More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0096 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  246  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  63.64 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  67.77 
 
 		 121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  67.77 
 
 		 121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  67.77 
 
 		 121 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  66.12 
 
 		 121 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  66.12 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  65.29 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  66.94 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  61.16 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  57.98 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  57.98 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  50 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  48.67 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  42.5 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  40.68 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.61 
 
 		 711 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.79 
 
 		 423 aa  90.9  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  43.4 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 236 aa  86.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 383 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  38.46 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.79 
 
 		 318 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  43.69 
 
 		 799 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  44.66 
 
 		 234 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  40.2 
 
 		 734 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  40 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  39.47 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  39.47 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  40.57 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.83 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2686  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  37.72 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  45.71 
 
 		 539 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.39 
 
 		 1499 aa  80.5  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 232 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  45.05 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 311 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  35.71 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  35.85 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.32 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.32 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  38.83 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  37.5 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  38.39 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2629  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.66 
 
 		 483 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  38.39 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  38.39 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1326  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 485 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  38.39 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  37.5 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  37.17 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2607  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>