More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1693 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  93.39 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  77.5 
 
 		 121 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  76.67 
 
 		 121 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  75.83 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  76.67 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  75.83 
 
 		 121 aa  197  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  74.17 
 
 		 121 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  70 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  72.03 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 137 aa  180  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  72.5 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 124 aa  163  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  60 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  63.11 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  48.25 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  47.54 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  46.15 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  95.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  41.88 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 236 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  43.24 
 
 		 513 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  43.14 
 
 		 734 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  42.5 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.52 
 
 		 711 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 574 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 318 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.79 
 
 		 423 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 612 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.79 
 
 		 2301 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2607  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  39.66 
 
 		 2284 aa  87  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  39.5 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 702 aa  85.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 215 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 452 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 887 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 387 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 414 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 248 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 127 aa  84.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.89 
 
 		 1499 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 452 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 243 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  38.26 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  40.35 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.11 
 
 		 1987 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.61 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.75 
 
 		 2336 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  37.96 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  41.35 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2686  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  40.35 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.72 
 
 		 767 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.11 
 
 		 1992 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  39.32 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.78 
 
 		 1131 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 564 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.21 
 
 		 718 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>