More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2686 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2686  response regulator receiver protein  100 
 
 		 153 aa  299  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  34.75 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  33.05 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  32.48 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  33.05 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  34.21 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.17 
 
 		 777 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 567 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  28.81 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 		 331 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 887 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  30.25 
 
 		 734 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.56 
 
 		 385 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.9 
 
 		 711 aa  63.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  30.56 
 
 		 1023 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  32.69 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 969 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  32.69 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 394 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  38.38 
 
 		 556 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  33.58 
 
 		 402 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  31.73 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 331 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.51 
 
 		 313 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  36.89 
 
 		 971 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 768 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  31.43 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  31.07 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  39.78 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  32.14 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 768 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 768 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2857  sensory box/response regulator  34.13 
 
 		 754 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2180  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  32.69 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  32.74 
 
 		 2051 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 699 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.73 
 
 		 906 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0007  two component Fis family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.04 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 576 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 768 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 418 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.13 
 
 		 2284 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.32 
 
 		 696 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  33.91 
 
 		 781 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2607  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  39.33 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 770 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  30.51 
 
 		 794 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1275 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 414 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 450 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  45 
 
 		 438 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 		 348 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 352 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  25.86 
 
 		 414 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.25 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.65 
 
 		 2301 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 1240 aa  57.4  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 		 351 aa  57.4  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  28.57 
 
 		 1127 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 989 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 841 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  34.19 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  37.39 
 
 		 1257 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1907 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.34 
 
 		 634 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>