More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2435 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  100 
 
 		 438 aa  880    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  39.27 
 
 		 305 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1173  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 128 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 280 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.86 
 
 		 280 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 397 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  34.03 
 
 		 302 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  30.7 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  32.68 
 
 		 730 aa  93.2  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.81 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  28.37 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  29.29 
 
 		 292 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.75 
 
 		 274 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.02 
 
 		 280 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 		 287 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  29.22 
 
 		 305 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 297 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  27.6 
 
 		 299 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.03 
 
 		 292 aa  86.7  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.17 
 
 		 293 aa  86.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  27.13 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.87 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.35 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  28.7 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 703 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.37 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.57 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  25.66 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.71 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  28.32 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.53 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.14 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  25.69 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  28.96 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 291 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 		 298 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.17 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 680 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  28.5 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 		 279 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.14 
 
 		 716 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  28.16 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  30.85 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3872  Metal-dependent hydrolase HDOD  30.43 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  26.17 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.21 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  25.44 
 
 		 790 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.83 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26.6 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  25.87 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  23.7 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  27.71 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  29.11 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  29.19 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.7 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  25.53 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  25.74 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  27.59 
 
 		 274 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>