More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3076 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 408 aa  826    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  54.17 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  41.45 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  41.52 
 
 		 289 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  41.61 
 
 		 283 aa  222  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  41.88 
 
 		 287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  39.54 
 
 		 289 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  41.6 
 
 		 352 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  30.24 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 		 353 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  41.63 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 		 286 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  33.79 
 
 		 369 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  36.36 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 		 279 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  31.99 
 
 		 284 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  30.38 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.81 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 280 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 280 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  29.34 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  30.3 
 
 		 281 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  30 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.96 
 
 		 287 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 		 284 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  34.54 
 
 		 650 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.91 
 
 		 280 aa  120  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 282 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.63 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 300 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 284 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 297 aa  111  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  27.19 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  27.06 
 
 		 281 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  29.96 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  27.14 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  30.1 
 
 		 280 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 285 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 284 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 282 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  30.42 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 		 297 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  31.75 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.88 
 
 		 505 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  33.49 
 
 		 275 aa  99.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.87 
 
 		 303 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.57 
 
 		 275 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.22 
 
 		 634 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.7 
 
 		 716 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  33.18 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.47 
 
 		 302 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.68 
 
 		 297 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  23.76 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  24.26 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  22.08 
 
 		 297 aa  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.72 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  32.42 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  30.37 
 
 		 293 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 		 288 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  30.1 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  33.7 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  29 
 
 		 285 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 280 aa  88.2  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  29.02 
 
 		 275 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  28.09 
 
 		 282 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 		 282 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  28.83 
 
 		 290 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  28 
 
 		 285 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 544 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  27.72 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 718 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>