More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1592 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
703 aa  1403    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  30 
 
 
730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.68 
 
 
716 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.75 
 
 
655 aa  280  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  29.58 
 
 
724 aa  260  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.68 
 
 
696 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  29.24 
 
 
718 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 
544 aa  190  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0084  histidine kinase  39.04 
 
 
653 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.218046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3726  histidine kinase  31.48 
 
 
654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
699 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
673 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.56 
 
 
516 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
862 aa  98.2  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.64 
 
 
346 aa  97.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0905  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.57 
 
 
360 aa  97.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0340364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 
283 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
298 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  31.34 
 
 
363 aa  94.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.64 
 
 
516 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 
300 aa  94  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
656 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.79 
 
 
519 aa  93.2  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  31.34 
 
 
348 aa  92.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  35.07 
 
 
830 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 
283 aa  92  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
898 aa  91.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
544 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
348 aa  90.9  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.55 
 
 
611 aa  90.5  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.36 
 
 
348 aa  90.9  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.617913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
397 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
378 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
557 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3560  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.53 
 
 
351 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
1519 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.11 
 
 
348 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
736 aa  88.6  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  34.76 
 
 
710 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
375 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  30.71 
 
 
382 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0258  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
348 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3763  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
348 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
348 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.627159  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.03 
 
 
361 aa  88.6  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.11 
 
 
348 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
375 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
674 aa  88.2  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  32.88 
 
 
592 aa  88.2  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
348 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0262  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
348 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.507954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2628  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
375 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
375 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  33.49 
 
 
623 aa  87.8  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.03 
 
 
361 aa  87.4  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 
283 aa  87.4  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  29.91 
 
 
610 aa  87  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  31.31 
 
 
655 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1619  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.6 
 
 
377 aa  87  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 
284 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.09 
 
 
357 aa  87  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  31.09 
 
 
663 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
631 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  28.77 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  33.02 
 
 
622 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  36.04 
 
 
506 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.59 
 
 
350 aa  86.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
729 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  27.44 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
592 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
679 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
505 aa  86.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1575  nitrogen regulation protein  31.8 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0711174  normal  0.0291432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  27.44 
 
 
498 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4471  nitrogen regulation protein  31.19 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0321  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.36 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
872 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.88 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01589  nitrogen regulation protein NR(II)  30.57 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  30.48 
 
 
801 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
701 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.97 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.14 
 
 
578 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0283  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.91 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323653 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  29.78 
 
 
676 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  31.36 
 
 
887 aa  84.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
656 aa  84  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.11 
 
 
673 aa  84  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25 
 
 
280 aa  84  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  30.24 
 
 
438 aa  84  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  27.44 
 
 
498 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
674 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
900 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
488 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  27.83 
 
 
498 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
492 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 
299 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  29.3 
 
 
505 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>