More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3011 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 378 aa  746    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  51.85 
 
 		 369 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  37.72 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 		 353 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  41.43 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  33.45 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  34.53 
 
 		 287 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 		 289 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 291 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 407 aa  159  9e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 		 455 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.57 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  37.79 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  36.26 
 
 		 280 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  40.4 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 280 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  32.24 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  36.19 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  33.21 
 
 		 279 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 283 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  36.6 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  34.3 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 		 280 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.29 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  34.31 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 		 284 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 718 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.58 
 
 		 505 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 		 285 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 		 298 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  27.15 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.91 
 
 		 716 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 650 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.81 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.9 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  27.73 
 
 		 283 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  31.8 
 
 		 276 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  27.27 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.3 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.39 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  37.76 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  28.98 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 661 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 		 297 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  32.38 
 
 		 289 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 		 290 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  34.8 
 
 		 302 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.43 
 
 		 275 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  27.65 
 
 		 281 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  32.74 
 
 		 292 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  30.51 
 
 		 292 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  27.55 
 
 		 299 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.48 
 
 		 724 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  31.63 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 456 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  29.91 
 
 		 285 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 297 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  29.49 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  30.81 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.23 
 
 		 304 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  31.13 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  35.83 
 
 		 258 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.69 
 
 		 634 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  31.22 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  25.47 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  25.85 
 
 		 285 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 297 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  32.33 
 
 		 275 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>