More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2222 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
655 aa  1323    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
703 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.47 
 
 
716 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.46 
 
 
730 aa  200  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.21 
 
 
696 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  26.04 
 
 
724 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
718 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0084  histidine kinase  30.75 
 
 
653 aa  127  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.218046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
544 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3726  histidine kinase  33.48 
 
 
654 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
755 aa  104  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
720 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  31.7 
 
 
552 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  33.62 
 
 
1347 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  31.25 
 
 
625 aa  94  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
725 aa  92  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
408 aa  91.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
862 aa  91.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  30.83 
 
 
625 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  30.91 
 
 
712 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  31.16 
 
 
498 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1513  sensor histidine kinase  30.7 
 
 
423 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.18 
 
 
519 aa  90.1  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
929 aa  90.5  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 
870 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.33 
 
 
358 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.051036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 
416 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  29.58 
 
 
498 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
736 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1550  sensor histidine kinase  31.13 
 
 
420 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000335626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  29.11 
 
 
498 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
399 aa  88.2  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  31.13 
 
 
420 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  32.43 
 
 
349 aa  87.4  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  31.13 
 
 
420 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
559 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  32.43 
 
 
349 aa  87.4  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
487 aa  87  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1583  sensor histidine kinase, putative  29.3 
 
 
423 aa  87  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  30.05 
 
 
498 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1182  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
417 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4158  nitrogen regulation protein NR(II)  32.13 
 
 
349 aa  87  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4097  nitrogen regulation protein NR(II)  31.89 
 
 
349 aa  87  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.33 
 
 
365 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  30.13 
 
 
349 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
299 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.27 
 
 
420 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
781 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4288  nitrogen regulation protein NR(II)  32.2 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.49 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
734 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.75 
 
 
499 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  28.37 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  29.71 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.49 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4217  nitrogen regulation protein NR(II)  32.2 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732813  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  29.67 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.49 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  29.71 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  29.71 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4238  nitrogen regulation protein NR(II)  32.2 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.893304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4334  nitrogen regulation protein NR(II)  32.2 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  29.27 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0416  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.49 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000409707  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3961  nitrogen regulation protein NR(II)  32.13 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4395  nitrogen regulation protein NR(II)  32.2 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3487  sensor histidine kinase  28.27 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1191  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.55 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.310962  normal  0.462311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1111  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.55 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
622 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1118  nitrogen regulation protein NtrB  31.43 
 
 
367 aa  84  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1618  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.61 
 
 
384 aa  84  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
710 aa  83.2  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
576 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3832  sporulation kinase  31.75 
 
 
421 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000527947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  30.13 
 
 
630 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
300 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
621 aa  83.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1076  nitrogen regulation protein NtrB  31.43 
 
 
380 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
737 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0246  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.19 
 
 
373 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.1011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  29.6 
 
 
566 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1811  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.35 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.23 
 
 
367 aa  82.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4345  nitrogen regulation protein NR(II)  31.78 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
738 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1444  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.63 
 
 
361 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.852628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5858  two-component sensor NtrB  29.36 
 
 
358 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
412 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
804 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.78 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1776  histidine kinase  31.42 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2520  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.12 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  31.78 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>