More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3744 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  100 
 
 		 718 aa  1447    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  39.2 
 
 		 724 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  34.14 
 
 		 716 aa  349  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  28.1 
 
 		 730 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 703 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.19 
 
 		 696 aa  219  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  24.18 
 
 		 544 aa  145  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 		 291 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3726  histidine kinase  29.32 
 
 		 654 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 280 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 299 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 		 300 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 299 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 		 378 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.54 
 
 		 303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  33.49 
 
 		 284 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 397 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 283 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 283 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.68 
 
 		 280 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 284 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 283 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 		 297 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 		 289 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.29 
 
 		 287 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  31.63 
 
 		 304 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 298 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 280 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 297 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  27.54 
 
 		 289 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 286 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 		 297 aa  102  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 282 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  34.74 
 
 		 288 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 284 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 291 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 291 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  33.5 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  26.59 
 
 		 281 aa  100  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.1 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 284 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.34 
 
 		 369 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 425 aa  99.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 288 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  34.21 
 
 		 288 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 298 aa  99  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  28.73 
 
 		 509 aa  98.2  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 		 280 aa  97.8  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  27.57 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 		 297 aa  96.3  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  33.01 
 
 		 287 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 395 aa  95.5  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.0700818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.64 
 
 		 655 aa  95.9  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.97 
 
 		 279 aa  95.1  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  31.44 
 
 		 358 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  31.65 
 
 		 458 aa  94.7  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 293 aa  94.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.96 
 
 		 351 aa  94.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.76 
 
 		 747 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.76 
 
 		 747 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  27.63 
 
 		 274 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 297 aa  92.8  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  27.92 
 
 		 297 aa  92.8  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  30.91 
 
 		 458 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  28.69 
 
 		 468 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.92 
 
 		 351 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.26 
 
 		 747 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  30.91 
 
 		 458 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 282 aa  92  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0084  histidine kinase  26.65 
 
 		 653 aa  91.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.218046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  29.52 
 
 		 373 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.3 
 
 		 634 aa  90.9  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  30.45 
 
 		 458 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 284 aa  90.5  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  31.79 
 
 		 276 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  30.45 
 
 		 465 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 340 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  27.86 
 
 		 297 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 292 aa  89.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  30.77 
 
 		 275 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 285 aa  89.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  29.17 
 
 		 912 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  27.31 
 
 		 656 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.53 
 
 		 274 aa  89  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.04 
 
 		 517 aa  89  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 279 aa  88.2  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 656 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.85 
 
 		 1788 aa  87.8  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 284 aa  87.8  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.35 
 
 		 289 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  30.45 
 
 		 458 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  30.45 
 
 		 458 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 406 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 412 aa  87  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 673 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 279 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  27.78 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  28.51 
 
 		 610 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  22.96 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 277 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>