More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3726 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3726  histidine kinase  100 
 
 
654 aa  1283    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.57 
 
 
724 aa  164  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  32.19 
 
 
716 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
718 aa  130  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0084  histidine kinase  30.63 
 
 
653 aa  125  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.218046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  28.61 
 
 
730 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
703 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.48 
 
 
655 aa  110  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.03 
 
 
696 aa  99.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
544 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  27.31 
 
 
496 aa  89.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
557 aa  87.4  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.57 
 
 
517 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.84 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
699 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
780 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
695 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  29.82 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  29.82 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  25.58 
 
 
801 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  27.65 
 
 
595 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  27.65 
 
 
595 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  27.19 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
829 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  27.19 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  29.36 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.13 
 
 
611 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
591 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  25.58 
 
 
801 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  29.36 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  27.19 
 
 
595 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  25.58 
 
 
801 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  27.19 
 
 
595 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0340  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.83 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  25.58 
 
 
801 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  30.23 
 
 
369 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.67 
 
 
611 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  28.63 
 
 
367 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
378 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  27.57 
 
 
674 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  25.25 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.13 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
658 aa  79.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
801 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.285543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  29.82 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
736 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
399 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.86 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
590 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  26.73 
 
 
595 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.74 
 
 
710 aa  78.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.37 
 
 
581 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3759  sensor histidine kinase  28.33 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  29.36 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
738 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  27.83 
 
 
595 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
592 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.23 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  29.36 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  25.79 
 
 
363 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  30.23 
 
 
542 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
475 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  25.93 
 
 
522 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  31.13 
 
 
829 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
595 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  25.88 
 
 
571 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.17 
 
 
1215 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
598 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
857 aa  77  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.82 
 
 
351 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
847 aa  76.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.3 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  28.84 
 
 
611 aa  75.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
718 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.0700818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  29.92 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.35 
 
 
598 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
491 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
729 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  26.36 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  25.59 
 
 
737 aa  75.5  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0076  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000670582  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.82 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  25.63 
 
 
1255 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.55 
 
 
516 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  26.85 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
604 aa  74.7  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  27.35 
 
 
872 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  32.71 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
662 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>