More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6300 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  100 
 
 
1255 aa  2569    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  28.32 
 
 
1230 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  24.92 
 
 
1282 aa  361  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2197  two-component sensor histidine kinase (sensor protein AtoS)  27.49 
 
 
1234 aa  325  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.993549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  35.34 
 
 
471 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  34.03 
 
 
470 aa  265  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  37.01 
 
 
1347 aa  259  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  32.79 
 
 
484 aa  221  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  33.58 
 
 
573 aa  157  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
734 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
491 aa  145  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
594 aa  145  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
748 aa  144  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  32.06 
 
 
581 aa  144  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
581 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
752 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  37.18 
 
 
748 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
738 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
656 aa  138  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
731 aa  138  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  28.88 
 
 
656 aa  137  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  27.43 
 
 
674 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  31.52 
 
 
517 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.19 
 
 
487 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
494 aa  135  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
581 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
508 aa  135  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  34.48 
 
 
705 aa  134  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
655 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
736 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  33.33 
 
 
734 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
746 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  27.7 
 
 
499 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
756 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
733 aa  133  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  27.31 
 
 
673 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
737 aa  131  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
473 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
718 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
518 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
610 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
733 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  31.09 
 
 
712 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
532 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
845 aa  128  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
570 aa  128  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
710 aa  127  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  29.7 
 
 
655 aa  127  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
756 aa  127  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
516 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
639 aa  127  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
756 aa  127  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
756 aa  126  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  30.45 
 
 
516 aa  126  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
725 aa  126  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
516 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
708 aa  125  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
672 aa  125  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
480 aa  125  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
661 aa  124  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
749 aa  124  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
744 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  27.18 
 
 
661 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
640 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  25.2 
 
 
484 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
639 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  26.21 
 
 
672 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
671 aa  121  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
741 aa  121  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
803 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  32.54 
 
 
592 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
510 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.83 
 
 
819 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
816 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
655 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
641 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
592 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
753 aa  120  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
760 aa  119  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
390 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.8 
 
 
598 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
738 aa  119  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.96 
 
 
744 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
611 aa  118  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1927  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
596 aa  118  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
639 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  32.62 
 
 
774 aa  118  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1199  histidine kinase  32.64 
 
 
525 aa  118  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.893151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.13 
 
 
365 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
488 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1130  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
525 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.351901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
475 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
687 aa  116  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  29.6 
 
 
713 aa  116  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
779 aa  116  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
747 aa  116  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
662 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  26.06 
 
 
614 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
773 aa  115  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>