More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0498 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 399 aa  781    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1706  histidine kinase  35.48 
 
 		 444 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4495  sensory box sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 508 aa  170  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 1237 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 690 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  34.07 
 
 		 657 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4665  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 670 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  34.67 
 
 		 544 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 962 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 693 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 936 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  35.52 
 
 		 450 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3685  histidine kinase  33.46 
 
 		 708 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 1242 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0712  putative sensor histidine kinase  33.7 
 
 		 667 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0438  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 914 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 893 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5593  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  30.96 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 1226 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0096  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 692 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 560 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 885 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 893 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0081  histidine kinase  32.96 
 
 		 529 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  33.46 
 
 		 560 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1770  histidine kinase  30.74 
 
 		 778 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 789 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2884  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2545  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.79 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 632 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1306  histidine kinase  31.6 
 
 		 663 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0116699  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 632 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 779 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2516  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 805 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 579 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2270  ATPase domain-containing protein  29.03 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.250434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 900 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2545  histidine kinase  29.03 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 901 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03441  Signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 499 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 632 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 898 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2962  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 729 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0867  ATPase domain-containing protein  29.96 
 
 		 632 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  28.57 
 
 		 632 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1018  sensory box sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 648 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0660  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 625 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 833 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2473  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 550 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 662 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.578499  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  31.18 
 
 		 950 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.86 
 
 		 543 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1205  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 580 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2754  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2082  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  33.58 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0339315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 644 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  29.73 
 
 		 1250 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 545 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 699 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.899017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 900 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4414  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 919 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1781  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  32.84 
 
 		 454 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000350892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 781 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 683 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.853209  hitchhiker  0.00641465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5588  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 773 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 674 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 762 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 543 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000746218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 543 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.757334  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6050  putative sensor histidine kinase  27.08 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0736  ATPase domain-containing protein  31.29 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000490957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 607 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2113  ATPase domain-containing protein  27.07 
 
 		 757 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275639  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  31.53 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0547  sensor histidine kinase  30.22 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562104  normal  0.0134241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 729 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00567966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3249  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 546 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.632077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3894  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3756  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  32.4 
 
 		 567 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2390  histidine kinase  26.69 
 
 		 757 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.534498  normal  0.927047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  32.21 
 
 		 680 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 		 1022 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  31.89 
 
 		 566 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.94 
 
 		 1901 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 638 aa  116  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>