More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0532 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  556  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  40.88 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  37.04 
 
 
290 aa  215  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  38.6 
 
 
274 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  38.6 
 
 
274 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  38.24 
 
 
274 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  38.24 
 
 
274 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  38.24 
 
 
274 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  37.13 
 
 
274 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  37.13 
 
 
274 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  37.13 
 
 
274 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  37.59 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  37.32 
 
 
274 aa  185  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  34.58 
 
 
275 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  34.54 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  34.83 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.51 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  32.47 
 
 
292 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  27.88 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  30.59 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.51 
 
 
280 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  29.39 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.41 
 
 
300 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
299 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
412 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 
298 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.82 
 
 
303 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
299 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  33.16 
 
 
258 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
297 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.79 
 
 
352 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
280 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 
297 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.37 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 
297 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  24.55 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  24.55 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.06 
 
 
304 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.53 
 
 
730 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  27.27 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  22.98 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
340 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  29.57 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  23.9 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  25 
 
 
415 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.47 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  28.23 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.5 
 
 
716 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.2 
 
 
281 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.86 
 
 
427 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.35 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
397 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  24 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  27.69 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  22.66 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.23 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  26.99 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.89 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  24.77 
 
 
288 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  23.56 
 
 
326 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  24.06 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.57 
 
 
438 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  22.64 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.96 
 
 
517 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  24.71 
 
 
509 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  24.62 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  24.89 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 
455 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.77 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  23.96 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  24.02 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  25.34 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  27.14 
 
 
724 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  24.57 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  26.79 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  25.49 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  26.8 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  24.67 
 
 
544 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>