229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3872 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3872  Metal-dependent hydrolase HDOD  100 
 
 		 321 aa  649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3873  Metal-dependent hydrolase HDOD  42.18 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.812708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.31 
 
 		 280 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.27 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 353 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 280 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.96 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  29.38 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.53 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  27.36 
 
 		 650 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.9 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  26.89 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  28.79 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  30.05 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  29.56 
 
 		 912 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  29.69 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.61 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  30.43 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  24.35 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  28.08 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  28.08 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.46 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.76 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  28.41 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  27.13 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  30.88 
 
 		 509 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  23.89 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  25.58 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  25.4 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  25.25 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  22.8 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  31.09 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  22.96 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  30.77 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  23.38 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  22.77 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  23.92 
 
 		 408 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  27.69 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.7 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  21 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  24.08 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.51 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  23.16 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.69 
 
 		 718 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  23.16 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  24.87 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  25 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.79 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  20.51 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  24.08 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  24.06 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  24.04 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.64 
 
 		 716 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.57 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  23.15 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  23.04 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  24.12 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  23.3 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.63 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  22.68 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>