295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5126 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  100 
 
 		 256 aa  533  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  99.61 
 
 		 290 aa  533  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  98.44 
 
 		 290 aa  527  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  94.92 
 
 		 290 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  82.81 
 
 		 288 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  77.17 
 
 		 292 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  76.77 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  77.25 
 
 		 254 aa  417  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  77.25 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  70.08 
 
 		 288 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  50.2 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  49.61 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  38.49 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  34.58 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  31.17 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  34 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  32.23 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  30.71 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 397 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  32.61 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.24 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  33.71 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.8 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.55 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.35 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.35 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 297 aa  88.6  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 286 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 280 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 369 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.63 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  28.34 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.11 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  28.33 
 
 		 289 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 		 291 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.18 
 
 		 397 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  28.25 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 412 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.4 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  29.38 
 
 		 912 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  28.33 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2489  diguanylate cyclase  29.83 
 
 		 836 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2008  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.52 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.21 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.29 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  27.07 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  32.78 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  31.35 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.82 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  32.22 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  25.78 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  25.99 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.01 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  30.27 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  26.67 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.48 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1494  putative signal transduction protein  25.58 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000467466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  30.11 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.27 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  29.61 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.94 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>