More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0462 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  100 
 
 
313 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.16 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.88 
 
 
286 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.69 
 
 
289 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 
280 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  31.02 
 
 
302 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
408 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.35 
 
 
284 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  26.97 
 
 
287 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 
407 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
291 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
291 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  29.13 
 
 
352 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.96 
 
 
280 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
353 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 
289 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
297 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  29.95 
 
 
415 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.83 
 
 
279 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
282 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
291 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.51 
 
 
302 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 
378 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.87 
 
 
303 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  30.83 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 
279 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.24 
 
 
275 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  28.71 
 
 
517 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
412 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  24.59 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  28.23 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  24.62 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  24.62 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 
455 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.26 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25 
 
 
351 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 
544 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.1 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  24.23 
 
 
274 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  27.55 
 
 
373 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
425 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.83 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  32.76 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.68 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  25.42 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 
284 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  24.51 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  29.1 
 
 
496 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
297 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  23.92 
 
 
274 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  23.92 
 
 
274 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  23.92 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  23.92 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.67 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.57 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  23.77 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.04 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.63 
 
 
716 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  28.02 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  26.76 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  27.45 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.62 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  27.19 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  28.98 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.82 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  26.23 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  27.7 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  23.66 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  22.17 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  23.33 
 
 
634 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  25.24 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>